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数据上传
上传流程
1
准备数据
2
填写信息
3
上传文件
4
提交审核
数据标准说明
数据格式
表型数据支持 Excel(.xlsx, .xls)、CSV(.csv)和 TXT(.txt)格式。
字段说明
| 字段名 | 数据类型 | 说明 | 示例 | 是否必填 |
|---|---|---|---|---|
| individual_id | 字符串 | 个体ID,格式为品种代码+数字 | D1001 | 是 |
| sex | 字符串 | 性别,M为公猪,F为母猪 | M | 是 |
| birth_date | 日期 | 出生日期,格式为YYYY-MM-DD | 2024-01-15 | 是 |
| breed | 字符串 | 品种 | 杜洛克 | 是 |
| trait_name | 字符串 | 性状名称 | 日增重 | 是 |
| trait_value | 数值 | 性状值,保留两位小数 | 856.50 | 是 |
| unit | 字符串 | 单位 | g | 是 |
| measurement_date | 日期 | 测量日期,格式为YYYY-MM-DD | 2024-06-15 | 是 |
| age_days | 数值 | 测量时日龄 | 180 | 否 |
| location | 字符串 | 测量地点 | 北京 | 否 |
示例数据
individual_id,sex,birth_date,breed,trait_name,trait_value,unit,measurement_date,age_days,location
D1001,M,2024-01-15,杜洛克,日增重,856.50,g,2024-06-15,150,北京
D1002,F,2024-01-20,杜洛克,日增重,823.75,g,2024-06-20,152,北京
L2001,M,2024-01-18,长白猪,日增重,792.20,g,2024-06-18,151,上海
L2002,F,2024-01-22,长白猪,日增重,785.40,g,2024-06-22,152,上海
Y3001,M,2024-01-16,大白猪,日增重,823.00,g,2024-06-16,151,广州
Y3002,F,2024-01-21,大白猪,日增重,812.50,g,2024-06-21,152,广州
数据格式
基因型数据支持 PLINK(.bed/.bim/.fam)、VCF(.vcf/.vcf.gz)和 HAPMAP 格式。
PLINK 格式说明
PLINK 格式是最常用的基因型数据格式,包含三个文件:
- .bed:二进制基因型数据文件
- .bim:SNP 信息文件,包含 SNP ID、染色体位置等信息
- .fam:样本信息文件,包含个体 ID、家系信息、性别等
VCF 格式说明
VCF(Variant Call Format)是一种用于存储基因变异信息的标准格式,包含样本的基因型信息。
样本信息文件要求
| 字段名 | 数据类型 | 说明 | 示例 | 是否必填 |
|---|---|---|---|---|
| individual_id | 字符串 | 个体ID,格式为品种代码+数字 | D1001 | 是 |
| sex | 字符串 | 性别,M为公猪,F为母猪 | M | 是 |
| birth_date | 日期 | 出生日期,格式为YYYY-MM-DD | 2024-01-15 | 否 |
| breed | 字符串 | 品种 | 杜洛克 | 是 |
| sire_id | 字符串 | 父本ID | D0501 | 否 |
| dam_id | 字符串 | 母本ID | D0502 | 否 |
数据格式
系谱数据支持 Excel(.xlsx, .xls)、CSV(.csv)和 TXT(.txt)格式。
字段说明
| 字段名 | 数据类型 | 说明 | 示例 | 是否必填 |
|---|---|---|---|---|
| individual_id | 字符串 | 个体ID,格式为品种代码+数字 | D1001 | 是 |
| sire_id | 字符串 | 父本ID,未知用0表示 | D0501 | 是 |
| dam_id | 字符串 | 母本ID,未知用0表示 | D0502 | 是 |
| sex | 字符串 | 性别,M为公猪,F为母猪 | M | 是 |
| birth_date | 日期 | 出生日期,格式为YYYY-MM-DD | 2024-01-15 | 否 |
| breed | 字符串 | 品种 | 杜洛克 | 是 |
示例数据
individual_id,sire_id,dam_id,sex,birth_date,breed
D1001,D0501,D0502,M,2024-01-15,杜洛克
D1002,D0501,D0503,F,2024-01-20,杜洛克
D0501,D0201,D0202,M,2023-01-15,杜洛克
D0502,D0203,D0204,F,2023-01-20,杜洛克
D0503,D0201,D0205,F,2023-01-25,杜洛克
L2001,L0501,L0502,M,2024-01-18,长白猪
L2002,L0501,L0503,F,2024-01-22,长白猪
常见问题
如何选择数据类型?
根据您要上传的数据内容选择相应的数据类型:
- 表型数据:包括生长性能、肉质性状、繁殖性能等测量数据
- 基因型数据:包括芯片检测或测序得到的基因分型数据
- 系谱数据:包括个体的父母信息、出生日期等系谱信息
- 其他数据:包括图像、视频、传感器等其他类型的数据
数据上传后多久能审核完成?
一般情况下,数据审核会在1-3个工作日内完成。审核完成后,系统会通过邮件通知您审核结果。
数据上传失败怎么办?
如果数据上传失败,请检查以下几点:
- 文件格式是否符合要求
- 文件大小是否超过限制
- 网络连接是否稳定
- 数据格式是否符合标准
如果问题仍然存在,请联系我们的技术支持:support@example.com
上传的数据会被公开吗?
您上传的数据默认是私有的,只有您和被授权的用户可以访问。如果您希望将数据公开共享,请在上传时选择"公开共享"选项。
如何获取数据上传模板?
您可以在数据上传表单和数据标准说明部分下载相应的数据模板。模板中包含了示例数据和字段说明,请按照模板格式准备您的数据。