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首页 数据上传

上传流程

1
准备数据
2
填写信息
3
上传文件
4
提交审核

数据上传表单

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支持 Excel、CSV、TXT 格式,单个文件不超过 100MB

请确保您的数据符合以下标准格式:

  • 第一行为表头,包含个体ID、性别、日龄、性状值等字段
  • 个体ID格式:品种代码+数字,如 D1001(杜洛克)、L2001(长白猪)、Y3001(大白猪)
  • 性别代码:公猪(M)、母猪(F)
  • 日期格式:YYYY-MM-DD
  • 数值型数据保留两位小数

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支持 PLINK、VCF、HAPMAP 格式,单个文件不超过 500MB

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支持 Excel、CSV、TXT 格式,单个文件不超过 50MB

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支持多种格式,单个文件不超过 200MB

数据标准说明

数据格式

表型数据支持 Excel(.xlsx, .xls)、CSV(.csv)和 TXT(.txt)格式。

字段说明

字段名 数据类型 说明 示例 是否必填
individual_id 字符串 个体ID,格式为品种代码+数字 D1001
sex 字符串 性别,M为公猪,F为母猪 M
birth_date 日期 出生日期,格式为YYYY-MM-DD 2024-01-15
breed 字符串 品种 杜洛克
trait_name 字符串 性状名称 日增重
trait_value 数值 性状值,保留两位小数 856.50
unit 字符串 单位 g
measurement_date 日期 测量日期,格式为YYYY-MM-DD 2024-06-15
age_days 数值 测量时日龄 180
location 字符串 测量地点 北京

示例数据

individual_id,sex,birth_date,breed,trait_name,trait_value,unit,measurement_date,age_days,location
D1001,M,2024-01-15,杜洛克,日增重,856.50,g,2024-06-15,150,北京
D1002,F,2024-01-20,杜洛克,日增重,823.75,g,2024-06-20,152,北京
L2001,M,2024-01-18,长白猪,日增重,792.20,g,2024-06-18,151,上海
L2002,F,2024-01-22,长白猪,日增重,785.40,g,2024-06-22,152,上海
Y3001,M,2024-01-16,大白猪,日增重,823.00,g,2024-06-16,151,广州
Y3002,F,2024-01-21,大白猪,日增重,812.50,g,2024-06-21,152,广州
                                    

数据格式

基因型数据支持 PLINK(.bed/.bim/.fam)、VCF(.vcf/.vcf.gz)和 HAPMAP 格式。

PLINK 格式说明

PLINK 格式是最常用的基因型数据格式,包含三个文件:

  • .bed:二进制基因型数据文件
  • .bim:SNP 信息文件,包含 SNP ID、染色体位置等信息
  • .fam:样本信息文件,包含个体 ID、家系信息、性别等

VCF 格式说明

VCF(Variant Call Format)是一种用于存储基因变异信息的标准格式,包含样本的基因型信息。

样本信息文件要求

字段名 数据类型 说明 示例 是否必填
individual_id 字符串 个体ID,格式为品种代码+数字 D1001
sex 字符串 性别,M为公猪,F为母猪 M
birth_date 日期 出生日期,格式为YYYY-MM-DD 2024-01-15
breed 字符串 品种 杜洛克
sire_id 字符串 父本ID D0501
dam_id 字符串 母本ID D0502

数据格式

系谱数据支持 Excel(.xlsx, .xls)、CSV(.csv)和 TXT(.txt)格式。

字段说明

字段名 数据类型 说明 示例 是否必填
individual_id 字符串 个体ID,格式为品种代码+数字 D1001
sire_id 字符串 父本ID,未知用0表示 D0501
dam_id 字符串 母本ID,未知用0表示 D0502
sex 字符串 性别,M为公猪,F为母猪 M
birth_date 日期 出生日期,格式为YYYY-MM-DD 2024-01-15
breed 字符串 品种 杜洛克

示例数据

individual_id,sire_id,dam_id,sex,birth_date,breed
D1001,D0501,D0502,M,2024-01-15,杜洛克
D1002,D0501,D0503,F,2024-01-20,杜洛克
D0501,D0201,D0202,M,2023-01-15,杜洛克
D0502,D0203,D0204,F,2023-01-20,杜洛克
D0503,D0201,D0205,F,2023-01-25,杜洛克
L2001,L0501,L0502,M,2024-01-18,长白猪
L2002,L0501,L0503,F,2024-01-22,长白猪
                                    

常见问题

如何选择数据类型?

根据您要上传的数据内容选择相应的数据类型:

  • 表型数据:包括生长性能、肉质性状、繁殖性能等测量数据
  • 基因型数据:包括芯片检测或测序得到的基因分型数据
  • 系谱数据:包括个体的父母信息、出生日期等系谱信息
  • 其他数据:包括图像、视频、传感器等其他类型的数据

数据上传后多久能审核完成?

一般情况下,数据审核会在1-3个工作日内完成。审核完成后,系统会通过邮件通知您审核结果。

数据上传失败怎么办?

如果数据上传失败,请检查以下几点:

  • 文件格式是否符合要求
  • 文件大小是否超过限制
  • 网络连接是否稳定
  • 数据格式是否符合标准

如果问题仍然存在,请联系我们的技术支持:support@example.com

上传的数据会被公开吗?

您上传的数据默认是私有的,只有您和被授权的用户可以访问。如果您希望将数据公开共享,请在上传时选择"公开共享"选项。

如何获取数据上传模板?

您可以在数据上传表单和数据标准说明部分下载相应的数据模板。模板中包含了示例数据和字段说明,请按照模板格式准备您的数据。